Il Museo in Via della Quarquonia all'interno di un'antica villa. Scopo del museo è illustrare il percorso storico-artistico di Lucca e del suo contado. Le collezione principali comprendono una raccolta archeologica con reperti preistorici, etruschi e romani, una raccolta di sculture e dipinti dal Medioevo al Barocco e una raccolta di arredi sacri e tessuti. Il Museo conserva anche reperti di interesse storico-scientifico come apparati provenienti dall'Ospedale di San Luca (in deposito presso la Pinacoteca Nazionale di Palazzo Mansi) e alcuni strumenti di misura sette-ottocenteschi. Possiede, inoltre, una collezione di strumenti per la misurazione del peso e delle lunghezze in uso nel territorio lucchese nel secolo XIX (gli oggetti sono attualmente in deposito nel sottotetto di Villa Guinigi e non sono visibili).